Consta haberse formado en la Universidad de Alcalá de Henares. Vivió primero en Valladolid, hasta 1541, para trasladarse en esa fecha a Toledo, ciudad que ya no abandonará.

En efecto, Villalpando se traslada a Toledo para labrar una de sus piezas más importantes, la reja de la Capilla Mayor y el Coro de Sillas de la catedral de Santa María de Toledo, obra a la que accede en esa fecha tras ganar en concurso frente a otros artesanos como Cristóbal de Andino, vecino de Burgos, o Maestre Domingo, vecino de Toledo, que lo hace conjuntamente con su yerno, Hernando Bravo, por un montante de 8.900 ducados, en un plazo de 5 años. Según consta en actas del archivo de la catedral, la reja estaba terminada el 19 de junio de 1548.^[3]​

En 1557 firmará un nuevo encargo para la catedral de Santa María de Toledo, el guarnecido de bronce y hierro de la Puerta de los Leones, trabajo en el que le llega la muerte y habrá de terminar su hermano, Rui Díez del Corral.^[3]​

Según Felipe Picatoste, tradujo del toscano al castellano y publicó en Toledo, en 1552, los libros tercero y cuarto del tratado de arquitectura Tutte l'opere d'architettura et prospettiva, del italiano Sebastiano Serlio, con lo que comenzó la publicación de los primeros tratados de arquitectura en España, y favoreció el conocimiento de las más novedosas técnicas de la época a otros artistas españoles. La obra de Serlio se reimprimió en 1563 y 1573, después de la muerte de Villalpando.^[3]​

• Corral de Villalpando

• «Francisco de Villalpando». Artehistoria. Archivado desde el original el 6 de febrero de 2012. Consultado el 4 de octubre de 2010. 

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• Francisco de Villalpando, en artehistoria.com
• Francisco de Villalpando y las rejas de la Catedral de Toledo