Nació a mediados del siglo XVI en el seno de una familia ilustre, originaria de Limpias.^[2]​ Recibió una esmerada educación literaria y siguió la carrera eclesiástica.^[2]​

En Burgos obtuvo la dignidad de arcediano de Briviesca.^[2]​ Hacia el año 1576 se trasladó a Roma, donde fue nombrado protonotario apostólico.^[2]​

Vivía aún a principios del siglo XVII.^[2]​

Se dedicó a la escritura y la traducción, y publicó las siguientes obras:^[1]​

• Frutos admirables de los que hazen limosna, obra que tradujo;
• Vida de la princesa de Parma, traducida del italiano; y
• Una composición poética incluida en la Justa poética en honor de san Isidro de Lope de Vega.

• Martínez Añíbarro y Rives, Manuel (1889). «Alvarado (Francisco de)». Intento de un diccionario biográfico y bibliográfico de autores de la provincia de Burgos. Madrid: Imprenta y Fundición de Manuel Tello. Wikidata Q64064166. 
•   Partes de este artículo incluyen texto de Intento de un diccionario biográfico y bibliográfico de autores de la provincia de Burgos (1889), una obra de Manuel Martínez Añíbarro y Rives (1850-1920) en dominio público.