Francisco Antonio Aldao Aragón nació en la ciudad de Buenos Aires, Gobernación del Río de la Plata (Imperio Español), en 1774, hijo de Antonio Basilio de Aldao^[1]​ y de Josefa de Aragón Avendaño, porteña. Al igual que sus hermanos Santiago Aldao y Matías Aldao sentó plaza en la Real Compañía de Guardiamarinas del Ferrol en 1793 con sólo 18 años, cerca del límite de edad permitido.

En 1794 fue ascendido a alférez de fragata y en 1802 era promovido a alférez de navío.

En 1805 operó a bordo de la corbeta Atrevida en aguas de las Islas Malvinas, pasando luego a la Descubierta, las mismas naves que participaron de la llamada "Expedición Malaspina", comandada por el famoso marino italiano en el servicio de España Alejandro Malaspina, construidos especialmente para el viaje y bautizados así por Malaspina en honor de los navíos de James Cook Resolution y Discovery.

En la Descubierta arribó con su hermano Santiago a Montevideo el 14 de abril de 1805, donde pasó a la fragata de 35 cañones Asunción, con la que zarpó a comienzos de mayo desde Maldonado para perseguir corsarios ingleses. La Asunción varó el 20 de mayo en el banco Inglés en medio de un temporal y al anochecer se hundió pereciendo Aldao en el naufragio junto a su comandante el capitán Juan Domingo Deslobbes, otros 10 oficiales y 294 hombres.

Es mencionado erróneamente como partícipe de la Batalla de Trafalgar a bordo del Príncipe de Asturias, nave insignia del Jefe de Escuadra Federico Gravina (murió antes del célebre combate). En el Romance de los Argentinos en Trafalgar^[2]​ unos versos dicen:

Nueve eran los argentinos

que estaban en Trafalgar,

Nueve los guardiamarinas

En el Combate inmortal

...

Junto a Gravina, de gala,

Se encontraban los demás:

Francisco Aldao, Martin Warnes,

Eusebio Medrano, allá,

Con Francisco Guruchaga,

la tarde de Trafalgar.

• Academia Nacional de la Historia (Argentina), Investigaciones y ensayos, Número 35, Academia Nacional de la Historia., 1987
• Humberto F. Burzio, Historia de la Escuela Naval Militar, Departamento de Estudios Históricos Navales, 1972
• Vicente Osvaldo Cutolo, Nuevo diccionario biográfico argentino (1750-1930), Editorial Elche, 1968.
• Yaben, Jacinto R., Biografías argentinas y sudamericanas, 1938
• Carranza, Ángel Justiniano, "Campañas Navales de la República Argentina", Talleres de Guillermo Kraft Ltda., Buenos Aires, 2º edición, 1962.
• Arguindeguy, Pablo E. CL, y Rodríguez, Horacio CL; "Buques de la Armada Argentina 1810-1852 sus comandos y operaciones", Buenos Aires, Instituto Nacional Browniano, 1999.

• Batalla de Trafalgar.
• Sitio oficial de la Armada de la República Argentina (ARA).
• Sitio oficial de la Armada Española.
• Cronología del Almirante Brown
• Historia y Arqueología Marítima
• Maniobras y términos navales