Tras completar sus estudios en Suiza, Jaeggy se fue a vivir a Roma, donde conoció a Ingeborg Bachmann y Thomas Bernhard. En 1968 se fue a Milan a trabajar para la editorial Adelphi Edizioni y se casó con Roberto Calasso. Su primera obra maestra fue la novela I Beati anni del castigo (1989). El Times Literary Supplement nombró su novela Proleterka como el mejor libro de 2003.^[1]​ También es traductora al italiano de Marcel Schwob y Thomas de Quincey.Gran parte de su literatura ha recibido la definición de "Novelas Metafísicas", es considerada una autora "de Culto" y una de las autoras Italianas con mayor peso en el panorama mundial.

Jaeggy trabajó con el músico italiano, Franco Battiato,^[2]​ bajo el pseudónimo de Carlotta Wieck.

• Il dito in bocca, Adelphi Edizioni, 1968.
• Le statue d'acqua, Adelphi, 1980. Trad. esp.: Las estatuas de agua. Barcelona: Alpha Decay, 2015. (Trad. de Mª Ángeles Cabré.)
• I Beati anni del castigo, Adelphi, 1989. Trad. esp.: Los hermosos años del castigo. Barcelona: Tusquets, 1991. (Trad. de Juana Bignozzi.)
• Proleterka, Adelphi, 2001. Trad. esp.: Proleterka. Barcelona: Tusquets, 2004. (Trad. de Angeles Cabré.)
• Vite congetturali, Adelphi, 2009.

• L'angelo custode, Adelphi, 1971. Trad. esp.: El angel de la guarda. Barcelona: Tusquets, Cuadernos Ínfimos 1974. (Trad. de Mariano Solivellas.)

• La Paura del cielo, Adelphi, 1994. Trad. esp.: El temor del cielo. Barcelona: Tusquets, 1998. (Trad. de Flavia Company.)
• Sono il fratello di XX, Adelphi, 2014. Trad. esp.: El último de la estirpe. Barcelona: Tusquets, 2016. (Trad. de Beatriz de Moura.)

• Marcel Schwob, Vite immaginarie, Adelphi, 1972.
• Thomas de Quincey, Gli ultimi giorni di Immanuel Kant, Adelphi, 1983.

• Fleur Jaeggy en ItaliaLibri