Flavobacterium es un género de bacterias perteneciente al grupo de las flavobacterias organotrofas. Se trata de bacilos aerobios, inmóviles. Gram negativos. Típicos de agua dulce y salada, alimentos, y plantas procesadoras. Es una especie comensal en ciertos animales acuáticos. Pigmentadas de color amarillo/naranja.

Flavobacterium
Enfermedad columnaris (Flavobacterium columnare) en las branquias de un salmón.
Taxonomía
Dominio:	Bacteria
Filo:	Bacteroidota
Clase:	Bacteroidia
Orden:	Flavobacteriaceae
Familia:	Flavobacteriaceae
Género:	Flavobacterium Bergey, et al. 1923
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Existe asimismo alguna especie patógena oportunista de humanos y peces. Por ejemplo, Flavobacterium psychrophilum causa la enfermedad del agua fría.

Algunas especies o géneros relacionados tienen carácter psicrófilo.