La Federación Europea de Sociedades de Microbiología (en inglés, Federation of European Microbiological Societies, FEMS) es una organización científica europea internacional, formada por la unión de varias organizaciones nacionales; actualmente la conforman 54 miembros, provenientes de 38 países europeos, regulares y provisionales.^[1]​ Sus miembros pueden solicitar becas, subvenciones y/o apoyo para la organización de conferencias y reuniones. La FEMS facilita el intercambio de conocimientos científicos a todos los microbiólogos en Europa y en todo el mundo mediante la publicación de cinco revistas de microbiología y la organización de un congreso bienal para microbiólogos a nivel mundial (FEMS Congress en junio de 2019). También inicia campañas como la Academia Europea de Microbiología (en inglés European Academy of Microbiology, EAM)^[2]​

Desde 1977, es el patrocinador de FEMS Microbiology Letters, una revista única, que posteriormente fue seguida por 4 revistas más:

• FEMS Microbiology Letters

• FEMS Microbiology Reviews

• Pathogens and Disease a journal preceded by FEMS Immunology and Medical Microbiology

• FEMS Microbiology Ecology

• FEMS Yeast Research

Originalmente publicado para la Sociedad por Elsevier, posteriormente por Wiley-Blackwell, ahora son publicados por Oxford Prensa Universitaria.