Nació en Estocolmo en el seno de una destacada familia de editores fundada por su padre, Albert Bonnier, en 1837. Eva Bonnier estudió pintura con August Malmström y fue alumna de la sección de mujeres de la Real Academia Sueca de las Artes en Estocolmo en 1878. Junto a otra estudiante y amiga suya, Hanna Hirsch, viajó a París en 1883, donde se instaló hasta 1889. Su cuadro Música (1889) fue galardonado con una mención de honor en el Salón de París. Tras su regreso a Suecia en 1889, se mantuvo activa como pintora hasta aproximadamente el año 1900. La mayoría de sus obras consistían en retratos, como el de Lisen Bonnier, su cuñada; el industrial convaleciente Hjalmar Lundbohm, el político Moritz Rubenson, el educador Carl Jonas Meijerberg o el poeta Oscar Levertin. Varias de sus obras se encuentran en el Museo Nacional de Estocolmo.

A partir de 1900 Bonnier dejó la pintura y se dedicó a la filantropía, gracias la riqueza que había heredado. Estableció una fundación para el embellecimiento de Estocolmo que en sus primeros años financió pinturas y esculturas para instituciones y lugares públicos, como la Biblioteca Nacional de Suecia o la Universidad de Estocolmo, además de varias escuelas de la ciudad. La fundación sigue activa.

Eva Bonnier sufría depresiones frecuentes y finalmente de suicidó en 1909.

•  
  Autorretrato, 1886 (Bonnierska porträttsamling, Estocolmo)
•  
  Interior de un estudio en París, 1886 (Nationalmuseum, Estocolmo).
•  
  Magdalena, 1887 (privado)
•  
  Reflexión en azul, 1887 (Nationalmuseum)
•  
  Modistas, 1887 (Villa Bonnier)
•  
  El ama de llaves, 1890 (Nationalmuseum, Estocolmo)
•  
  Convaleciente, 1890 (Lisen Bonnier)
•  
  Julia Hasselberg, alrededor del 1906 (Museo Blekinge)

• Albert Bonniers Förlag
• Hanna Hirsch

• Gynning, Margareta: Det ambivalenta perspektivet: Eva Bonnier och Hanna Hirsch-Pauli i 1880-talets konstliv, Estocolmo, Bonnier, (diss. Universidad de Uppsala), 1999.
• Hedberg, Tor: "Bonnier, Eva Fredrika", Svenskt biografiskt lexikon, 5, p. 436@–438.

•   Wikimedia Commons alberga una categoría multimedia sobre Eva Bonnier.