Eupithecia chilensis es una especie de polilla de la familia Geometridae. La especie fue descrita por primera vez por Kemal y Kocak habiendo sido descrita en 2004, con distribución en Chile.^[1]​ El holotipo de la especie fue descrita en Región de Los Lagos en los alrededores de los ríos Huequi y trumao, a unos 22 kilómetros (13,7 mi) de Ouellón.^[2]​ Ha sido descrita al menos una vez como parte del grupo de especies europea linariata.^[3]​ Se ha unido junto con la especie de California, Eupithecia rindgei, descrita por Vojnits en 1992.^[4]​