Gilg fue curador del Museo botánico de Berlín. En coautoría con Heinrich Gustav Adolf Engler publica „Syllabus der Pflanzenfamilien“ (1921), y „Das Pflanzenreich“.

Se nombra en su honor el género botánico Gilgiochloa de la familia dee las gramíneas Poaceae.

• Pharmazeutische Warenkunde, 4ª ed. 1911
• Botánica aplicada a la Farmacia Editorial Labor S.A. traducido de la 6.ª ed. por Pio Font Quer, 1925. Grundzüge der Botanik für Pharmazeuten, 6.ª ed. 1921
• Lehrbuch der Pharmakognosie, 3ª ed. 1922
  • 1ª ed. - Berlín : Springer, 1905
  • 2.ª ed. - Berlín : Springer, 1910. en línea en Universitäts- und Landesbibliothek Düsseldorf

Identificó y nombró 42 especies, subespecies, subfamilias.

• La abreviatura «Gilg» se emplea para indicar a Ernest Friedrich Gilg como autoridad en la descripción y clasificación científica de los vegetales.^[1]​

• Zander, R. 1984. Fritz Encke, Günther Buchheim, Siegmund Seybold: Handwörterbuch der Pflanzennamen. Ulmer Verlag. Stuttgart. ISBN 3-8001-5042-5

• «Ernest Gilg». Índice Internacional de Nombres de las Plantas (IPNI). Real Jardín Botánico de Kew, Herbario de la Universidad de Harvard y Herbario nacional Australiano (eds.). 

•   Wikispecies tiene un artículo sobre Ernest Friedrich Gilg.

1. ↑ Todos los géneros y especies descritos por este autor en IPNI.