Bourgonjon se trasladó a los Países Bajos e hizo muchas esculturas y adornos de pared, incluyendo varios retratos en medallón. Fue gerente de estudio de la firma francesa de Pierre Cuypers y Frans Stolzenberg en Roermond. Enseñó escultura en la escuela de artesanías Quellinius en Ámsterdam y luego a la Academia de La Haya.

Entre las mejores y más conocidas obras de Emil Bourgonjon se incluyen las siguientes:

Ámsterdam

• Leones, etc a la Oficina Central de Correos (1895) del arquitecto del gobierno Cornelis Peters

Groninga

• Higía - Hygieia . fachada del antiguo laboratorio farmacológico de Higiene^[2]​ en la Broerstraat 9

La Haya

• Medallones - Retrato de juristas (1876-1883), Plein
• Casa de Gevelversiering (1896), Smidswater 26
• Medallón. Retrato de Simon Stevin (1898), Raamstraat 47
• Decoración de las fachadas de la casa W.B. van Liefland (1907), Bezuidenhoutseweg 3

Nimega

• Nueve leones del edificio de la estación (1894), Stationsplein^[3]​

Utrecht

• Medallones - Retratos (1891) de profesores en el edificio de la AcademiaAcademiegebouw^[4]​

• Anexo:Esculturas en el Centro de Groninga

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