Las elecciones presidenciales de Costa Rica de 1849 se realizaron tras el derrocamiento de José María Castro Madriz que fue obligado a renunciar. En aquel momento, el diputado Miguel Mora Porras, ejercía la presidencia interinamente y su hermano, Juan Rafael Mora Porras, resultó elegido por sobre Rafael Moya Murillo y Manuel Antonio Bonilla Nava.

← 1847 •  • 1853 →
Elecciones presidenciales de Costa Rica de 1849 Presidente de la República
Fecha						2 al 9 de diciembre de 1849
Tipo						Voto indirecto
Demografía electoral
Población					100 000
Votantes						90 Electores
Resultados
			Juan Rafael Mora Porras – Liberal
			Votos electorales					49
									54.44 %
			Rafael Moya Murillo – Liberal
			Votos electorales					32
									35.56 %
			Manuel Antonio Bonilla Nava – Liberal
			Votos electorales					9
									10 %
Votos obtenidos
Presidente de la República de Costa Rica
Titular Miguel Mora Porras interino Independiente (Liberal)						Electo Juan Rafael Mora Porras Independiente (Liberal)

La Constitución vigente en este período, la de 1848, restringía el derecho a votar a los hombres mayores de 21 años dueños de un bien inmueble equivalente a 300 pesos y una renta anual de al menos 150 pesos que además supieran leer y escribir, por lo que dichas elecciones eran realizadas mayormente entre la burguesía^[1]​

Los habitantes escogían a 90 electores quienes, en las elecciones de segundo grado, escogían al presidente. San José elegía 26, y Guanacaste 12 los cuales votaron en bloque por Mora, mientras que los 17 de Heredia, los 12 de Alajuela y los 2 de Puntarenas lo hicieron por Moya. Cartago tenía 20 electores de los cuales 11 votaron por Mora y los 9 restantes que fueron los únicos que votaron por Bonilla.^[2]​