Se trata de la mayor en extensión entre todas las Comandancias del Archipiélago, pues tiene 9,634 km².

Sus pueblos son:

• Mati de 2,475 almas, situado en la hermosa bahía de Pujada, con sus visitas de San Estanislao, La Concepción, La Paz, La Guía, San Alonso, El Pilar, Tamisan y Dac;
• Sigáboy (hoy oficialmanta Gobernador Generoso) de 2,217 almas, con sus visitas de Luzón, Pundaguitan, Monserrat, Nazaret, San Juan, Cuabo, Carmen, San Jaime, Javier, Macambol y Anunciación;
• Caraga, de 4,054, con las visitas de Manorígao, San Fernando, San Fermín, Mercedes, Concepción, Santiago, San Pedro, San José, Santa Fe, San Luis, San Francisco y Santa María;
• Manay de 2,649, con las visitas de Zaragoza, Santa Cruz, San Ignacio, Jovellar, Tarragona, Manresa y San Fernando;
• Cateel-Baganga, de 6,561 habitantes, con las visitas de San Nicolás, Dapnán, Quinablangán, Baculín, San Rafael, San Alfonso, San Antonio, San Víctor, Maybajay y Tagmoan.

En el siglo XIX, la población de las comandancias-político militares se componía de infieles repartidos en rancherías o de cristianos recién convertidos organizados en pueblos. En lo político eran regidas por un jefe u oficial del Ejército Español; con atribuciones tanto judiciales como económicas; en lo espiritual están la mayor parte administradas por misioneros, en Mati eran jesuitas, y algunas por párrocos.^[2]​

Su gobierno estaba a cargo de un oficial del ejército que ejerce las funciones judiciales con un secretario asesor letrado, y las económicas como subdelegado de hacienda.