La rama femenina fue creada en 2019 jugando en el Campeonato de Ascenso a la Serie B de futbol femenino. Quitando a los clubes del Astillero, fue el primer club profesional guayasense en incursionar desde la categorías bajas para subir a Primera División. Actualmente disputa la Súperliga Femenina de Ecuador, máxima categoría del fútbol femenino profesional en Ecuador, organizada por la Federación Ecuatoriana de Fútbol. Ha sido un constante participante a tal punto de ser la tercera fuerza de la ciudad y de la región.^{[cita requerida]}

Sus rivales tradicionales son Barcelona, además de Octubrinas -la sección de Nueve de Octubre- con quienes disputa la rivalidad durante los torneos de ascenso del Guayas.

El Club Sport Patria Femenino es local en el Samborondón Arena, un estadio multiusos, también sede de su rama masculina. Está ubicado en la ciudad de Samborondón, provincia de Guayas. Fue inaugurado en el año 2006. Es usado para la práctica del fútbol, Tiene capacidad para 2200 espectadores.

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1. ↑ «Guayaquil City presentó a su equipo de fútbol femenino». Consultado el 23 de julio de 2018. 
2. ↑ «Estadios - FEF». Archivado desde el original el 1 de enero de 2018. Consultado el 10 de junio de 2017. 
3. ↑ «Ñusta FC y CS Patria escalan a la elite del futbol femenino». www.futbolecuador.com. Consultado el 24 de abril de 2023. 

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