Los temas de mayor interés de Christopher Isham son la Gravedad cuántica y el estudio y análisis de los fundamentos de la teoría cuántica. Isham fue el inventor de un formalismo basado en un tipo de lógica temporal llamado "el formalismo HPO", y también ha trabajado en la Gravedad cuántica de bucles y en Geometrodinámica cuántica. Junto con John Baez, Isham está a favor de la utilización de la Teoría de categorías en la física teórica. En años recientes, desde por lo menos los años noventa, ha estado trabajando en una nueva aproximación a la mecánica cuántica basada en la teoría de Topos.

Isham ha aparecido en varios programas de Nova, una serie de televisión estadounidense, así como en una película sobre Stephen Hawking. El físico Paul Davies ha descrito a Isham como "El mayor experto en gravedad cuántica de toda Gran Bretaña"^[3]​

• 2011: Premio Dirac por sus trabajos en Gravedad cuántica.^[4]​

• Isham, C. J., Physics, Philosophy, and Theology, 1988
• Christopher Isham, "Quantum Theories of the Creation of the Universe," in R. Russell, N. Murphy and C. J. Isham (eds.), Quantum Cosmology and the Laws of Nature (Vatican City: Vatican Press, 1993), p. 74.
• Christopher Isham, "Creation of the Universe as a Quantum Tunnelling Process," in (eds. R. J. Russell et al.), Physics, Philosophy and Theology (Vatican City: Vatican Press, 1988), pp. 375–408.
• Isham, C. J. (1993), “Canonical Quantum Gravity and the Problem of Time”, in L. A. Ibort and M. A. Rodríguez (eds.), Integrable Systems, Quantum Groups, and Quantum Field theories. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 157-288.
• Isham, C. J., K. V. Kuchař, Representations Of Space-Time Diffeomorphisms. 2. Canonical Geometrodynamics," Annals of Physics 164:316 (1985).
• Isham, C. J. (1994), Prima facie questions in quantum gravity, in Ehlers and Friedrich 25 (1994), 1-21.
• Isham, C. J. (1997), “Structural Issues in Quantum Gravity”, in M. Francaviglia et al. (eds.), Florence 1995, General Relativity and Gravitation, World Scientific.
• Butterfield, Jeremy, and Chris Isham (1999), “On the Emergence of Time in Quantum Gravity”, in Butterfield (1999), 111-168.
• Butterfield, Jeremy, and Christopher Isham (2001), “Spacetime and the Philosophical Challenge of Quantum Gravity”, in Craig Callender and Nick Huggett (eds.) (2001), 33-89.
• Döring, Andreas and Isham, Chris, "What is a Thing?: Topos Theory in the Foundations of Physics", in Bob Coecke, New Structures in Physics, Chapter 13, pp. 753–940, Lecture Notes in Physics, 813, Springer, 2011, ISBN 978-3-642-12820-2, (also see arΧiv:0803.0417v1)