La pasión por la Encyclopédie, con la que conviviría más de 20 años, surgió cuando André Le Breton y Diderot concluyeron su actividad. Se dedicó a reeditar la Encyclopédie en tamaño folio, le añadió dos tomos de índices preparados por Pierre Mouchon que aparecieron en 1780, publicó un suplemento de cinco volúmenes que aparecieron entre 1776 y 1777 y participó en las labores que permiten editarla en cuarto de pliego. Por último, su mayor aportación fue la publicación de la Encyclopédie méthodique (Enciclopedia Metódica), una expansión y reordenación de la Encyclopédie ordenada por materias en lugar de alfabéticamente. Recibió la licencia en 1780 y publicó un primer prospecto en 1782. El proyecto le sobrevivió con su hija Thérèse-Charlotte Agasse, que publicó el último de los 166 volúmenes en 1832.

Panckouke también fue un destacado y próspero editor de libros y periódicos. Poco antes de la Revolución francesa, en 1779 comenzó la edición del periódico Mercure de France^[1]​ y fundó Le Moniteur universel en noviembre de 1789. También llegó a dominar otros periódicos como La Gazette, Le Journal de Bruxelles y Le Journal de Genève.

Como editor fue un empresario de éxito que difundió la obra de los filósofos de la Ilustración como Buffon y Voltaire. Su hijo Charles Louis Fleury Panckoucke continuó su actividad en la literatura y en el negocio de la edición.

• Robert Collison, Encyclopaedias: Their History Throughout the Ages, 2nd ed. (New York, London: Hafner 1966) pp. 134-135.
• Robert Darton, The business of enlightenment: a publishing history of the Encyclope'die, (Cambridge: The Belknap Press of Harvard University 1979).

• (en inglés) David I. Kulstein, « The Ideas of Charles-Joseph Panckoucke, Publisher of the Moniteur Universel, on the French Revolution», French Historical Studies, vol. 4, n.° 3. Spring, 1966, p. 304-319