En el Cerro de los Tres Picos se pueden observar distintos tipos de materiales que fueron depositados por la erupción volcánica, en forma de derrames de lava, explosiones de materiales piroclásticos y gases. Debido a que se encuentra en el Eje Neovolcánico, sigue los mismos patrones de formación y evolución geológica que se han presentado en el eje, por lo que se puede decir que su formación es del Plioceno-Holoceno.

Se presentan cuatro tipos de suelo en el cerro: luvisol (39 %), acrisol (34%), leptosol (24%) y regosol (2%) Se encuentra rodeado por los siguientes cerros:

• Al este, el cerro de Los Gavilanes, altitud promedio 2000 m s. n. m.
• Al noreste, el cerro de Los Cajones, altitud 2140 m s. n. m.
• Al oeste, suroeste y noroeste, la Sierra de Caramécuaro, 1800 m s. n. m.

Altitud promedio

• Al sur, la Sierra de La Parota, altitud promedio 1600 m s. n. m.
• Al norte, la Sierra de Las Joyas Altas, altitud promedio 1800 m s. n. m.

Esta zona Montañosa cuenta con algunos animales y plantas típicas de la región

• Zarza
• Tillandsia ionantha
• Pinus devoniana
• Quercus glaucoides
• Sciurus carolinensis
• Coragyps atratus
• Tlacuache
• Phaeophyceae

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