La casa Cicogna debe observarse desde el contexto de su emplazamiento, rodeada de lujosos palacios a lo largo del Gran Canal, como la interpretación actual de la casa típica del patriciado veneciano del siglo XIII.^[2]​ Se levanta a lo largo de la fondamenta del Zattere, con la fachada principal al canal de la Giudecca, la fachada lateral a la estrecha calle dello Zuccaro y el límite oriental adosado a la iglesia del Espíritu Santo.^[3]​ El edificio cuenta con cinco plantas, a excepción del lateral anejo a la iglesia que, para marcar una distancia entre las dos construcciones, se separa de la línea de fachada con un ligero retranqueo y dispone solo de tres alturas. La fachada principal está revocada con gravilla de ladrillo, con detalles en zócalos, pretiles de los balcones y cornisas de las ventanas en mármol.^[3]​ La casa retoma el habitual esquema del palacio veneciano, subdividido en sótano, planta noble y ático.^[2]​ El diseño de la fachada se caracteriza por la irregularidad en la disposición de los huecos y de los balcones, en clara evocación al carácter de la arquitectura menor de las casas venecianas.^[4]​^[1]​