Desde el año 2009 hasta 2018 fue profesora Asociada del Departamento de Geografía de la Facultad de Arquitectura, Urbanismo y Geografía de la Universidad de Concepción. Ha sido directora de la Revista Geográfica del Sur entre 2012 y 2014. Tras no resultar elegida Vicedecana en la renovación del decanato de la Facultad de Arquitectura, Urbanismo y y Geografía de la Universidad de Concepción en octubre de 2018, deja esta universidad en diciembre de ese año. Actualmente es Subdirectora de Investigación y Desarrollo del Instituto de Estudios Urbanos y Territoriales de la Facultad de Arquitectura, Diseño y Estudios Urbanos de la Pontificia Universidad Católica de Chile^[2]​ e Investigadora Principal del Centro de Desarrollo Urbano Sustentable.^[3]​

También formó parte del directorio de la Asociación Chilena de Ecología del Paisaje entre 2015 a 2019.^[4]​

Desde el año 2015, la doctora Rojas trabaja en la investigación sobre la urbanización de los humedales urbanos desde una perspectiva geográfica, urbana y social, el cual durante el 2018 ha tenido un considerable impacto en la política pública, apoyando la conformación de la Red Ciudadana Nacional de Humedales,^[5]​ el desarrollo de material académico, público general y para organizaciones ambientales.

A fines de 2017, fue invitada por el Ministerio del Medio Ambiente para escribir^[6]​ el capítulo dedicado a los humedales del libro La Vía del Medio Ambiente.^[7]​

Por su expertise e investigación, fue invitada por la Comisión de Medio Ambiente y Bienes Nacionales del Congreso Nacional para el proyecto de Ley de Protección de Humedales Urbanos,^[8]​ presentado por el senador Alfonso de Urresti, en el cual ha participado frecuentemente, aportando evidencias científicas para la protección y gestión de estos ecosistemas.

Ha sido panelista, columnista y entrevistada sobre temas medioambientales y de difusión científica en medios de comunicación como el canal TVU,^[9]​ Diario Concepción,^[10]​ Diario el Sur,^[11]​ La Tercera,^[12]​ El Mostrador,^[13]​ Cooperativa,^[14]​ entre otros.

Su trabajo se basa en el análisis espacial del crecimiento urbano, los modelos de accesibilidad y el desarrollo urbano sostenible de estos con un enfoque en la ecología urbana, el tráfico vehicular y la movilidad urbana. En particular, su investigación trata sobre cómo las ciudades pueden ser accesibles y cómo los humedales se ven afectados por la infraestructura de urbanización y transporte. Sus estudios recientes tratan sobre humedales y cómo podemos acceder a ellos.^[14]​^[15]​

Esta es una lista de los trabajos científicos más citados de la investigadora; para revisar el listado completo revisa el perfil del investigador en Google Scholar.^[16]​

• Rojas Quezada, Carolina Alejandra; Muñiz Olivera, Iván; García-López, Miguel Ángel (2009-08). «Estructura urbana y policentrismo en el Área Metropolitana de Concepción». EURE (Santiago) (en inglés) 35 (105). ISSN 0250-7161. doi:10.4067/S0250-71612009000200003. Consultado el 8 de marzo de 2020. 
• Rojas, Carolina; Pino, Joan; Basnou, Corina; Vivanco, Mauricio (2013-05). «Assessing land-use and -cover changes in relation to geographic factors and urban planning in the metropolitan area of Concepción (Chile). Implications for biodiversity conservation». Applied Geography (en inglés) 39: 93-103. doi:10.1016/j.apgeog.2012.12.007. Consultado el 8 de marzo de 2020. 
• Villagra, Paula; Rojas, Carolina; Ohno, Ryuzo; Xue, Ma; Gómez, Karina (2014-03). «A GIS-base exploration of the relationships between open space systems and urban form for the adaptive capacity of cities after an earthquake: The cases of two Chilean cities». Applied Geography (en inglés) 48: 64-78. doi:10.1016/j.apgeog.2014.01.010. Consultado el 8 de marzo de 2020. 
• Rojas, Carolina; Páez, Antonio; Barbosa, Olga; Carrasco, Juan (2016-12). «Accessibility to urban green spaces in Chilean cities using adaptive thresholds». Journal of Transport Geography (en inglés) 57: 227-240. doi:10.1016/j.jtrangeo.2016.10.012. Consultado el 8 de marzo de 2020. 
• Rojas, Carolina; Sepúlveda-Zúñiga, Einer; Barbosa, Olga; Rojas, Octavio; Martínez, Carolina (2015-09). «Patrones de urbanización en la biodiversidad de humedales urbanos en Concepción metropolitano». Revista de geografía Norte Grande (en inglés) (61): 181-204. ISSN 0718-3402. doi:10.4067/S0718-34022015000200010. Consultado el 8 de marzo de 2020.