El Caraguatypotherium era un animal de tamaño mediano, con un peso estimado de entre 100 y 200 kilogramos. Tenía un cuerpo robusto y patas cortas, con pies de cinco dedos. Su cráneo era grande y de hocico corto, con dientes fuertes adaptados para moler materia vegetal.^[3]​

Era un herbívoro que se alimentaba de plantas duras y fibrosas. Se cree que vivía en ambientes abiertos, como bosques secos y sabanas.

Los fósiles de Caraguatypotherium se han encontrado en la Formación Huaylas, en el norte de Chile.^[4]​ Esta formación se depositó en un lago durante el Mioceno tardío, y contiene una rica fauna de fósiles de mamíferos, incluyendo otros notoungulados, así como roedores, marsupiales y primates.