La historia del templo está unida a la del hospital, mandado a construir por el obispo Alonso de la Mota. Sin embargo, antes de esto, la Compañía de Jesús realizó un colegio donde se enseñaba teología escolástica, moral y filosofía.^[3]​ Más tarde, a mediados del siglo XVII,^[4]​ se decidió realizar el hospital para la atención de los indios, y un templo para los servicios espirituales de los mismos. La realización del edificio corrió a cargo de Francisco de Aguilar y el precio estimado fue de veintitrés mil pesos oro.^[3]​

Bajo la administración de la Compañía de Jesús, el templo fue una capilla del colegio jesuita, y más tarde también fue administrado por los agustinos; esto mientras su templo (dañado durante el Sitio de Puebla) era reconstruido.^[3]​

Durante el siglo XVIII, en la edificación del hospital (junto a la capilla) se estableció el hospicio para pobres. En 1863, el edificio se dañó y en el siglo XX fue restaurado por Emilio López Vaal.^[3]​

Posee una portada de cantera gris, característica de los inicios del barroco en Puebla. El arco de la entrada es un arco de medio punto con almohadillado; característica que se repite en la ventana del coro. El arquitrabe también presenta el almohadillado, en forma radial.^[5]​

El interior, sin bancas pues ya no está destinado al culto, posee un estilo neoclásico. En el testero tiene un ciprés, y en la parte de atrás lo adorna un altar neoclásico pintado, el cual está dividido en veintiún paneles. La pintura da un efecto de perspectiva y espacialidad. "De fondo gris, a modo de piedra, incluye la simulación arquitectónica de un par de ventanas y unos nichos que incluyen esculturas en blanco; ninguno de los paneles “respeta” estos elementos, sino que se complementan al ser armado."^[6]​

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