Con la reducción del número de participantes de 20 a 16 equipos, los equipos serán divididos en cuatro grupos de cuatro equipos cada uno. Los equipos de un grupo enfrentan a los clubes de los otros grupos. En total, cada equipo participante disputa 12 partidos en la primera fase. Los dos primeros clasificados de cada grupo avanzan a cuartos de final, que se disputan en partido único en casa del club con mejor campaña de la primera fase. Las semifinales también son disputadas en partido único. La final se disputa en juegos de ida y vuelta, sin tener en cuenta el gol en condición de visitante.

Los tres primeros del campeonato clasificarán para la Copa de Brasil de 2021. Si uno de ellos, resulta clasificado a la Copa Libertadores 2019, el cuarto ubicado será el clasificado y así, sucesivamente. Para esta edición, descenderán 2 equipos y ascenderán 2 para la edición del 2019. Los descendidos resultarán de la tabla general que reúne a todos los equipos.

En caso de que haya dos o más equipos empatados en puntos al finalizar la primera fase del campeonato, los criterios de desempate son:^[2]​

1. Mayor número de partidos ganados.
2. Mejor diferencia de gol.
3. Mayor número de goles a favor.
4. Menor número de tarjetas rojas recibidas.
5. Menor número de tarjetas amarillas recibidas.
6. Sorteo.

En caso de que haya dos equipos empatados en puntos al finalizar la segunda, tercera o cuarta fase (cuartos de final, semifinales y final) del campeonato, el desempate se realizará, directamente, en tiros desde el punto penal.

• Água Santa fue ascendido a la Serie A1 del 2020 luego de que Red Bull Brasil se fusionara con Bragantino, conformando el nuevo equipo Red Bull Bragantino.^[3]​^[4]​

Actualizado el 8 de agosto de 2020.