Los mejores amigos Fred, Daphne, Shaggy, Vilma y su inseparable compañero Scooby-Doo acaban de resolver un nuevo misterio e intentan celebrarlo, pero son interrumpidos por el Sheriff de Gruta de Cristal (su ciudad natal), que los encarcela por meterse en sus asuntos, reprochándoles por haber resuelto un crimen cuando ese es su trabajo, y diciéndoles burlonamente que ya los ha acusado con sus padres y que ahora están en problemas. Los chicos se van con sus padres y tratan de convencerlos, uno por uno, que los dejen resolver misterios juntos.

Gruta de Cristal se ha ganado el título de "El lugar más encantado de la Tierra" por su historial de escalofriantes apariciones de fantasmas y monstruos, avistamientos de criaturas horribles y otros fenómenos paranormales, pero eso no evita que Scooby y los chicos sientan curiosidad por cada cosa que encuentran en su camino. Muchos turistas visitan el pueblo en busca de presenciar dichos sucesos, y los padres de Vilma, dueños del museo de la ciudad, hacen que ella trabaje guiando a los turistas. Al día siguiente del lío con el Sheriff, en medio de una de estas visitas guiadas al museo, Vilma se cansa y les dice a un par de turistas que todos los monstruos y fantasmas que visitaron la ciudad resultaron ser falsos. El padre de Fred y alcalde del pueblo está tratando que su terco hijo dé el ejemplo no pensando en misterios y siendo responsable. Y tanto los padres de Shaggy como los de Daphne quieren que sus hijos encuentren otros amigos.

Mientras los chicos suben a la Máquina del Misterio y se dirigen a la escuela, unos albañiles que construían en las cercanías de las cuevas debajo de Gruta de Cristal, se topan con una parcela de tierra llena de deshechos radiactivos. Pese a esto continúan cavando, hasta que de pronto una bestia mutante emerge de las profundidades y los trabajadores desaparecen.

A bordo de la camioneta, Vilma intenta que Shaggy no sea tan tímido y sea más romántico con ella, pero él no quiere revelarle aún a nadie que ellos dos son novios, por miedo a como vaya a reaccionar su mejor amigo Scooby. En eso, la bestia mutante se les aparece y los ataca. Freddy decide que un misterio es más importante que ir a la escuela, así que la pandilla sigue al monstruo hasta las cavernas de Gruta de Cristal, donde descubren los cuerpos de los trabajadores petrificados, congelados en una sustancia desconocida. Daphne encuentra un extraño medallón y decide conservarlo.

El Sheriff Stone llega para sacar a los chicos por estar en un área restringida, pero ellos se le enfrentan, Fred roba uno de los cuerpos y escapan en la Máquina del Misterio. Esperando obtener alguna guía, la pandilla le lleva el cuerpo al profesor Emmanuel Raffalo, un maestro de biología en la escuela secundaria Gruta de Cristal. y este les dice que los trabajadores no están muertos, si no en un estado de deshidratación muy grave, congelados en un capullo hecho de un material orgánico desconocido. Al terminar el día, los chicos van a relajarse a "Helados FruitMeirs", una nueva fuente de sodas que abrió hace un par de meses. El dueño es un joven de aspecto alegre llamado Franklin Fruitmeir que ha inventado una nueva clase de raspado. Al notar la cercanía entre sus amigos, Daphne le pregunta a Vilma si está pasando algo entre ella y Shaggy, pero Vilma lo niega y luego se van, dejando a Fred y Daphne solos. Daphne, (que ha estado lanzándole indirectas a Fred para que él sepa que ella está enamorada de él) le invita a dar un paseo, pero Fred está más preocupado por resolver misterios y armar trampas, por lo que se despide y se marcha a su casa. Esa misma noche, el profesor Raffalo desaparece, habiendo sufrido el mismo destino que los trabajadores.

Al día siguiente, los chicos van a animar a un deprimido Fred, que estaba refugiándose en la estación de radio K-Ghoul sintiéndose culpable. De repente, Scooby-Doo descubre que el capullo con el que la bestia congela a sus víctimas está hecho del mismo material que el postre de FruitMeirs, cuyo dueño apareció solo hace dos meses de la nada en el pueblo, y ahora está contratando chicas para que lo ayuden en el negocio. Shaggy y Scooby se disfrazan de chicas (porque Vilma y Daphne no quisieron ir) y así la pandilla se infiltra en la fuente de sodas para buscar pistas. Daphne tropieza y cae en un agujero que conduce a las cuevas de Gruta de Cristal, y los chicos descubren que el hoyo está construido justo sobre el banco de la ciudad. Conociendo ya el objetivo de la bestia, los chicos arman una trampa para atraparla, pero terminan siendo congelados como todos los anteriores. Daphne escapa, mientras los demás se liberan comiendo el postre, y logran capturar al monstruo, rescatando Fred a Daphne en el último momento.

El alcalde y el Sheriff llegan a la escena y todo apunta a que el culpable fue Franklin Fruitmeir. Pero Franklin aparece, diciendo que él fue quien había llamado al Sheriff, lo que significa que la bestia es en realidad... ¡el profesor Emmanuel Raffalo!. Inconforme con lo poco que le pagaban como maestro, Raffalo había descubierto que una de las cuevas de Gruta de Cristal (conectadas a las alcantarillas) estaba justo sobre el banco, así que creó a la bestia para poder cavar hasta él sin que nadie lo molestara, y usó el postre Fruitmeir en sus víctimas para que culparan a Franklin de todo, incluyendo su desaparición. Sin embargo, luego de resolver el misterio, hay una pieza que no encaja: ¿a quién le pertenece el medallón que Daphne encontró? no es del profesor Raffalo, pues este dice nunca haberlo visto. La pregunta queda sin responder, hasta que en la estación de radio, los chicos reciben la llamada de un hombre misterioso conocido como el "Señor E", que les dice que no debieron sacar aquel medallón de las cuevas, pues no saben lo que han liberado: una verdad que debió permanecer oculta, la maldición de Gruta de Cristal ha caído sobre ellos. Ahora, el misterio a penas ha comenzado.

• En este episodio, Vilma les menciona a los turistas algunas famosas criaturas que fueron vistas en los alrededores de la ciudad: El fantasma del Capitán Cutler, el Minero 49, Charly el robot y el Fantasma del otro Mundo. Estos son villanos que aparecieron en la serie original de 1969 ¿Scooby-Doo dónde estás?. El Fantasma del Capitán Cutler apareció en el segundo episodio, «Una pista para Scooby-Doo», el Minero 49 era un espectro de un rancho del Oeste que apareció en el episodio 4, «El Fantasma de Ciudad de Oro», Charly era un robot de un parque de diversiones que apareció en el episodio 8: «Falla divertida en los juegos mecánicos», y el Fantasma del otro Mundo (llamado en el doblaje Cook Espacial) apareció en el episodio 15: «El Fantasma del Aeropuerto abandonado». La mención de dichos villanos es lógica, puesto que esta serie se ubica cronológicamente luego de la original ¿Scooby-Doo dónde estás?.
• En este episodio, nos enteramos por primera vez que Daphne tiene cuatro hermanas y que todos sus nombres empiezan con la letra 'D'. Las hermanas de Daphne son 2 pares de gemelas llamadas Daisy, Dawn, Dorothy y Delilah.
• Cuando Vilma le pregunta a Shaggy por qué la dejó esperando anoche, él le dice que se quedó mirando una película de Vincent Van Ghoul, haciendo referencia a uno de los personajes de la serie Los 13 fantasmas de Scooby-Doo (1985) que es una estrella de películas de horror, a manera de póstomo homenaje a su actor original, Vincent Price.
• El personaje del profesor Emmanuel Raffalo está basado en el famoso conductor de programas de horror estadounidense Mister Lobo.
• Uno de los turistas que acompaña a Vilma en la visita guarda mucha semejanza con el actor Don Knotts, quien ha participado activamente en la franquicia Scooby-Doo en distintas películas y apareció en tres episodios de la serie Las nuevas películas de Scooby-Doo, del año 1972.
• Cuando Vilma está con los turistas en el museo, se puede ver un monstruo parecido al Fantasma Lunar, un personaje que apareció en la primera película con actores reales de Scooby-Doo.

• Jeff Bennett como el Profesor Emmanuel Raffalo, turista.
• Dee Bradley Baker como Franklin Fruitmeir, bestia de las alcantarillas
• Fred Tatasciore - Trabajador N.º 1
• Mitch Watson como Ethan
• Tony Cervone como Gary

Créditos técnicos:

• Dirección de casting: Collette Sunderman
• Grabación de voces: Chris Egert
• Grabación y mezcla de efectos de sonido: Robert Hargreaves

• Luis Alfonso Padilla - Fred Jones
• Yolanda Vidal - Daphne Blake.
• Irene Jiménez - Vilma Dinkley
• Arturo Mercado Chacón - Shaggy Rogers
• Antonio Gálvez - Scooby-Doo, narración y traducción verbal
• José Luis Orozco - Sheriff Bronson Stone
• Víctor Covarrubias - Alcalde Fred Jones, Sr.
• Javier Rivero - Dale Dinkley, trabajador en construcción 1
• Ruth Toscano - Angela "Angie" Dinkley
• Elena Ramírez - Nan Blake
• Mildred Barrera - Angel Dinamita
• Gabriel Pingarrón - Profesor Emmanuel Raffalo
• Gustavo Melgarejo - Franklin Fruitmeir

Créditos técnicos:

• Dirección de doblaje - Antonio Gálvez
• Estudio de doblaje - Sensaciones Sónicas, S.A. de C.V.
• País de doblaje - México  México^[2]​

En su estreno exclusivo el 5 de abril de 2010, el episodio logró posicionarse como la emisión principal de la cadena Cartoon Network, alcanzando picos de hasta 2.7 millones de espectadores aproximadamente. En su estreno oficial el 12 de julio del mismo año, la audiencia del capítulo promedió los 2.5 millones de televidentes aproximadamente. Hasta la fecha, es el episodio con la mayor cantidad de espectadores que ha tenido el programa.

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• Beware the Beast From Below en Internet Movie Database (en inglés).