Las Semifinales de la Supercopa Sudamericana 1988 corresponden a la tercera ronda de la fase final de la competencia. Debido a la imposibilidad de estructurar un cuadro simétrico con un número impar de participantes, Racing Club de Argentina, que fue eximido de jugar los cuartos de final, se reincorporó para esta ronda.

Se disputaron partidos en ida y vuelta. Como criterios de desempate ante la igualdad de puntos, se utilizaron —en el mencionado orden—, la diferencia de goles, la cantidad de goles convertidos como visitante y, en última instancia, los tiros desde el punto penal.^[1]​