• Arces > Arces-Dilo*
• Dilo > Arces-Dilo*

• Chailley > Chailley-Turny*
• Turny > Chailley-Turny*

• Aigremont > Lichères-Aigremont*
• Bessy-sur-Cure > Lucy-sur-Cure
• Bligny-en-Othe > Brienon-sur-Armançon
• Bouilly > Vergigny
• Commissey > Tanlay
• Cusy > Ancy-le-Franc
• Essert > Lucy-sur-Cure
• Fleurigny > Thorigny-sur-Oreuse
• Fye > Chablis
• Lichères-près-Aigremont > Lichères-Aigremont*
• Louesme > Champignelles
• Milly > Chablis
• Môlay > Annay-sur-Serein
• Paroy-en-Othe > Brienon-sur-Armançon - commune rétablie en 2004
• Perreuse > Treigny
• Poinchy > Chablis
• Préhy > Saint-Cyr-les-Colons
• Rebourseaux > Vergigny
• Rosoy > Sens - commune rétablie en 2008
• Sainte-Colombe-sur-Loing > Treigny
• Sainte-Vertu > Annay-sur-Serein
• Saint-Martin-sur-Oreuse > Thorigny-sur-Oreuse
• Saint-Vinnemer > Tanlay
• Villemer > Neuilly

• Brannay > Brannay-Saint-Sérotin
• Chastenay > Ouanne
• Courceaux > Perceneige*
• Escolives-Sainte-Camille > Coulanges-la-Vineuse
• Grange-le-Bocage > Perceneige*
• Lavau > Saint-Fargeau
• Merry-Sec > Ouanne
• Mézilles > Saint-Fargeau
• Plessis-du-Mée > Perceneige*
• Ronchères > Saint-Fargeau
• Saint-Martin-des-Champs > Saint-Fargeau
• Saint-Sérotin > Brannay-Saint-Sérotin
• Septfonds > Saint-Fargeau
• Sognes > Perceneige*
• Sougères-sur-Sinotte > Monéteau
• Vaux > Auxerre
• Vertilly > Perceneige*
• Villiers-Bonneux > Perceneige*
• La Villotte > Villiers-Saint-Benoît

• Avrolles > Saint-Florentin
• La Chapelle-Vieille-Forêt > Flogny-la-Chapelle*
• Flogny > Flogny-la-Chapelle*

• Civry-sur-Serein > Massangis
• Montacher > Montacher-Villegardin*
• Villegardin > Montacher-Villegardin*

• Chichy > Hauterive

• La Mothe-aux-Aulnaies > Charny

• Avigneau > Escamps
• Bailly > Saint-Bris
• Gouaix > Saint-Bris
• Saint-Eusoge > Rogny

• Cours > Grimault
• Villiers-la-Grange > Grimault

• Les Clérimois > Foissy - (commune rétablie en 1888)
• Perrigny > Annay-sur-Serein
• Vallerie > Thorigny-sur-Oreuse

• Rétablissement de Rosoy à partir de Sens

• Rétablissement de Paroy-en-Othe à partir de Brienon-sur-Armançon

• Rétablissement de Ronchères à partir de Saint-Fargeau

• Rétablissement de Préhy à partir de Saint-Cyr-les-Colons

• Rétablissement d'Aigremont et de Lichères-près-Aigremont à partir de Lichères-Aigremont, commune supprimée

• Rétablissement de Bessy-sur-Cure à partir de Lucy-sur-Cure

• Rétablissement de Merry-Sec à partir d'Ouanne

• Rétablissement de Chailley et de Turny à partir de Chailley-Turny, commune supprimée
• Rétablissement de Escolives-Sainte-Camille à partir de Coulanges-la-Vineuse
• Rétablissement de Môlay à partir d'Annay-sur-Serein
• Rétablissement de Sainte-Vertu à partir d'Annay-sur-Serein
• Rétablissement de Villemer à partir de Neuilly

• Rétablissement de Lavau à partir de Saint-Fargeau
• Rétablissement de Mézilles à partir de Saint-Fargeau
• Rétablissement de Sainte-Colombe-sur-Loing à partir de Treigny
• Rétablissement de Saint-Martin-des-Champs à partir de Saint-Fargeau

• Rétablissement de Brannay et de Saint-Sérotin à partir de Brannay-Saint-Sérotin, commune supprimée

• Rétablissement des Clérimois à partir de Foissy et de Chigy

• Sougères-sur-Sinotte par démembrement de la commune de Gurgy

• Saint-Sérotin par démembrement des communes de Brannay, Lixy, Nailly, Pont-sur-Yonne et Villeperrot

• Moutiers > Moutiers-en-Puisaye

• Rogny > Rogny-les-Sept-Écluses

• Champs > Champs-sur-Yonne

• Aillant > Aillant-sur-Tholon
• Bessy > Bessy-sur-Cure
• Pacy > Pacy-sur-Armançon
• Saint-André > Saint-André-en-Terre-Plaine
• Saint-Sauveur > Saint-Sauveur-en-Puisaye

• Escolives > Escolives-Sainte-Camille

• Fleury-Vallée-d'Aillant > Fleury-la-Vallée
• Foissy > Foissy-sur-Vanne
• Précy > Précy-sur-Vrin
• Sainte-Colombe > Sainte-Colombe-sur-Loing
• Saint-Martin > Saint-Martin-sur-Armançon
• Sougères > Sougères-en-Puisaye

• Argenteuil > Argenteuil-sur-Armançon

• Druyes > Druyes-les-Belles-Fontaines

• Civry > Civry-sur-Serein

• Asnières > Asnières-sous-Bois
• Chemilly > Chemilly-sur-Yonne
• Moulins > Moulins-en-Tonnerrois
• Saint-Georges > Saint-Georges-sur-Baulche
• Savigny > Savigny-sur-Clairis

• Courtois > Courtois-sur-Yonne

• Courlon > Courlon-sur-Yonne

• Voutenay > Voutenay-sur-Cure

• Chemilly-près-Seignelay > Chemilly

• Saint-Bris > Saint-Bris-le-Vineux

• Lichères > Lichères-sur-Yonne

• Tannerre > Tannerre-en-Puisaye

• Étais > Étais-la-Sauvin

• Chastellux > Chastellux-sur-Cure

• Aisy > Aisy-sur-Armançon
• Saint-Cydroine-Laroche > Laroche-Saint-Cydroine

• Theil > Theil-sur-Vanne

• Montigny-le-Roi > Montigny-la-Resle

• Saint-Léger-de-Fourcheret > Saint-Léger-Vauban

• Ancy-le-Serveux > Ancy-le-Libre
• Malay-le-Roi > Malay-le-Petit
• Malay-le-Vicomte > Malay-le-Grand
• Villeneuve-le-Roi > Villeneuve-sur-Yonne

* Creación de una nueva comuna

• (en francés) Les cartes de Cassini, base de données sur l'histoire des communes françaises
• (en francés) CommunesGenWeb, l'histoire des communes au service de la généalogie