Su nombre ha sido relacionado en el pasado con la localidad cordobesa de Pedroche, aunque no se puede afirmar que fuera su lugar de nacimiento; parte de los historiadores situaban en el pasado su origen bien como sevillano o bien como nacido en el territorio de Marruecos.^[4]​

Su trabajo es el culmen de la superación de la cosmología ptolemaica que realizó la filosofía aristotélica andalusí en el siglo XI,^[5]​ que posteriormente influyó en Copérnico para crear su modelo celeste.^[6]​ Miguel Escoto tradujo al latín la obra de Al-Bitruji Kitab al-hai’a —una crítica de Ptolomeo— en Toledo en el año 1217.^[5]​ Su modelo celeste consistía en un conjunto de esferas homocéntricas; a las inferiores el «primer motor» les trasmitía movimiento de manera proporcional a su distancia.^[2]​ Es destacable de sus ideas el establecimiento de una causalidad física a los movimientos de los cuerpos celestes.^[5]​

El catedrático de germanística de la Universidad de Salamanca, Feliciano Pérez Varas, considera que el Parzival, de Wolfram von Eschenbach hace referencia a este erudito en la figura del sabio astrónomo Flegetanis, quien habría mencionado al Grial. A través del poeta Kyot, quien sería en esta interpretación Miguel Escoto, de Dolet, es decir Toledo, la historia habría llegado hasta él.^[7]​

• El cráter lunar Alpetragius lleva este nombre en su memoria.^[8]​

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