Alexander Mendoza se inició en el Manta FC desde la categoría sub-12 hasta las de mayores, con la llegada de Jorge Alfonso al banquillo del Manta tuvo la oportunidad de jugar de titular indiscutible. Su debut en la Serie A fue en un partido de local contra el Deportivo Cuenca donde el Manta se opuso 3 tantos a 0. EL Manta no logró su objetivo de no descender en el 2014 a la serie B, luchó hasta la última fecha donde salió goleado de visitante 4-0 contra el Independiente José Terán.^[2]​