Fantino es hijo único. Dejó su ciudad natal para estudiar en el Liceo Militar General Belgrano, que, luego de tres años y medio, abandonó.^[3]​ Continuó sus estudios secundarios en el Colegio San Martín de San Francisco (Córdoba).

Luego de vivir en diferentes pensiones de la ciudad de San Rafael (Mendoza) y Posadas (provincia de Misiones), en donde estudió Petroquímica y Genética respectivamente (carreras que abandonó), llegó a Buenos Aires, con 18 años de edad, donde trabajó como profesor de tenis y como empleado de un vivero de barrio.^[4]​

El 30 de octubre de 2006, se casó con Miriam Lanzoni, la Gringa, una actriz de teatro nacida en Pampa del Infierno (provincia del Chaco). Tras diez años de matrimonio, la pareja se divorció en octubre de 2016.^[5]​ En el año 2008, reveló ser padre de un joven llamado Nahuel Johnathan Fantino, nacido en 1991 en San Francisco, Córdoba, y que se enteró de que era su padre cuando el niño tenía 11 años.^[6]​^[7]​

El 12 de noviembre de 2022, se casó con la modelo Constanza "Coni" Mosqueira.^[8]​ El 7 de noviembre de 2023, revelaron que esperan su primer hijo.^[9]​ El 11 de abril de 2024 anunciaron el nacimiento de su hijo Beltrán.

Con habilidad para los relatos deportivos, ingresó en la radio casi de casualidad en 1992 como relator de la campaña de Boca Juniors en Radio Mitre, como reemplazo de Héctor Caldiero, en el programa El show de Boca, donde estuvo hasta noviembre de 2002; poco a poco, fue ganándose un lugar en los medios.^[10]​

A partir de 2009 condujo los programas Animales sueltos y El show del fútbol en América TV.^[11]​ Desde 2010, y por dos años, trabajó en Radio 10 conduciendo el programa Hora pico junto con Gastón Recondo. En el año 2013. firmó contrato con Radio La Red AM 910. El conductor estaba a cargo de la franja que va desde las 16 hasta las 18 h de lunes a viernes, conduciendo su programa Uno de los nuestros. Ese mismo año, abandonó el programa El show del fútbol para abocarse solamente el programa Animales sueltos. Con Gustavo López como comentarista, relató los partidos de fútbol del mundial de Brasil 2014 para La Red. Aunque nunca estudió la carrera de Periodismo o la licenciatura en Comunicación Social, ejerce esa profesión.

Se presentó en los premios Emmy Internacional 2017 en el Hotel Hilton de Nueva York, en representación del programa Escuela para maridos, en la categoría entretenimiento sin guion.^[12]​

Realizó cómo conductor Intratables en América, después creó su propia emisora llamada Neura Media. Hasta el 29 de septiembre estuvo trabajando en ESPN en su última etapa con la cadena. Realizó ESPN FC, ESPN FC SHOW, que luego se convirtió en ESPN FShow, y fue despedido tras atacar duramente en una emisión de su cadena radial a sus colegas de ESPN Sebastián Vignolo y Mariano Closs.^[13]​

• Fuera de juego (1996)
• Club Social y Deportivo (1997-1998)
• Código F (1999-2000)
• Mar de fondo (1999-2005)

• La barra de la tele (1998)
• Por más (1999-2000)
• Los Osos (2002)
• Por amor o por dinero (2024)

• Gol por gol (2002)
• Fantino con todo (2003)
• TVO (2005-2006)
• Fuga a la medianoche (2006)
• Fuga a la noche (2006-2007)
• Tiempo límite Fan (2007)
• Tiempo límite ATP (2007)
• SDF (2009-2013)
• Animales sueltos (2009-2019, 2022)
• Víndica (2011)
• Animales sueltos: Clásico (2016-2017)
• Fantino a la tarde (2020-2021)
• Intratables (2021-2022)

• Bendita (2023)
• La última cena (2023)

• ESPN estudio (2006)
• ESPN FC (2020-2021)
• ESPN show (2020-2022)

• Escuela para maridos (2015)

• Talento FOX (2018)

• Multiverso Fantino (2022- actualidad)
• La Cosa en si (2023- actualidad)

Año	Programa	Radio
1992-2002	El show de Boca	Radio Mitre
1998-2000	Súper 80 deportivo
2001	A toda radio
2002	A toda radio	Rock & Pop
2003	Una de piratas	Aspen 102.3
2004	La deportiva Del Plata	Radio Del Plata
2005	La mejor vuelta	Mega 98.3
2006	Llamalo como quieras
2007-2010	Rápido y curioso	Radio Rivadavia
2008-2010	Música de primera	Radio Uno
2011-2012	Hora pico	Radio 10
2013-2019	Fantino 910	Radio La Red
2020-2021	Multiverso Fantino	Pop Radio 101.5
2022- Pres.	Multiverso Fantino	Neura Media FM 89.7

• 2013: Back to the Siam, hijo de Martín Fox^[14]​

Fue socio de la productora Dalí Producciones junto con Ricardo Cohen. En 2008, Dalí produjo dos programas de televisión conducidos por José Pablo Feinmann: Filosofía aquí y ahora, emitido por el canal Encuentro (del Ministerio de Educación), y Cine con texto, emitido por canal 7.

Obtuvo en total diez Martín Fierro, como mejor labor en conducción de programas deportivos en TV y en radio, juntamente a varios Martín Fierro de Cable como mejor labor en programa deportivo y mejor programa con Mar de fondo, también un Premio Tato, correspondiente a El show del fútbol, en 2013.

Año	Premios	Categoría	Programa	Resultado
2000	Premios Martín Fierro	Mejor labor en programa deportivo de radio AM	Súper 80 deportivo y El show de Boca	Ganador
2002	Premios Martín Fierro	Mejor labor periodística deportiva	Gol por gol	Nominado
2003	Premios Martín Fierro	Mejor labor periodística deportiva	Fantino con todo	Ganador
2005	Premios Martín Fierro	Mejor labor conducción masculina	TVO	Nominado
2006	Premios Martín Fierro	Mejor labor conducción masculina	TVO y Fuga a la medianoche	Nominado
2007	Premios Martín Fierro	Mejor labor conducción masculina	Noche de ronda, Tiempo límite Fan, Tiempo límite ATP y Fútbol en vivo	Nominado
2009	Premios Martín Fierro	Mejor programa deportivo	El show del fútbol	Ganador
2009	Premios Martín Fierro	Mejor labor conducción masculina	Animales sueltos y El show del fútbol	Nominado
2010	Premios Martín Fierro	Mejor programa deportivo	El show del fútbol	Nominado
2011	Premios Martín Fierro	Mejor programa deportivo	El show del fútbol	Nominado
2012	Premios Tato	Mejor programa deportivo	El show del fútbol	Nominado
2012	Premios Martín Fierro	Mejor programa deportivo	El show del fútbol	Nominado
2013	Premios Tato	Mejor programa deportivo	El show del fútbol	Ganador
2013	Premios Martín Fierro	Mejor programa deportivo	El show del fútbol	Nominado
2013	Premios Martín Fierro	Mejor labor conducción masculina	Animales sueltos	Ganador
2014	Premios Martín Fierro	Mejor conducción/locución masculina	Fantino 910	Nominado
2015	Premios Martín Fierro	Mejor labor periodística masculina	Animales sueltos	Nominado
2015	Premios Martín Fierro	Mejor programa de interés general	Animales sueltos	Ganador
2017	Premio Konex, diploma al mérito	Entre los cinco mejores periodistas televisivos de la última década		Ganador

El 2 de mayo de 2010, condujo, junto con Karina Mazzocco, la edición 2009-2010 de la entrega de los Premios Martín Fierro.

Apareció en el top 10 de una clasificación de relatores latinos populares durante la Copa Mundial de Fútbol de 2014 realizada por un diario deportivo brasileño. Entre otros narradores aparecen Christian Martinoli, Luiz Carlos Júnior, Javier Fernández Franco, Pablo Giralt, Mariano Closs, Gabriel Regueira, Galvão Bueno, Alberto Jesús López y Noé Vázquez.^[15]​