La trama del juego se desarrolla en un futuro indeterminado, con armas, aviones y entornos de ciencia ficción. Cuando la OCC (Comunidad Ciudadana Orbital), una colonia espacial situada en la órbita terrestre, se rebela y lanza una invasión a la Tierra, las EDAF (Fuerzas Aliadas de Defensa Terrestre) emprenden una campaña defensiva. Al principio de la guerra, las EDAF se ven superadas por la superioridad numérica y armamentística de la OCC, perdiendo la mayoría de sus fuerzas convencionales y viéndose obligadas a reclutar a cualquier milicia para ayudar, incluyendo al Escuadrón Delta, un grupo de ataque aéreo de mala fama conocido como un vertedero de pilotos deshonrados o inadaptados. A pesar de sus diferencias, los esfuerzos del Escuadrón Delta permiten a las EDAF cambiar el rumbo y liberar partes de la Tierra ocupadas por la OCC, lo que les granjea la atención y la rivalidad del escuadrón experimental de élite de la OCC. A medida que la marea comienza a cambiar y las fuerzas de la Tierra avanzan, descubren que OCC no es la principal amenaza: una organización de Marte planea destruir la Tierra con la ayuda de la colonia orbital.

AFDS ofrece una amplia selección de aviones y una serie de misiones. Sin embargo, a diferencia de las entregas anteriores, AFDS presenta un nuevo elenco de personajes de estilo anime, ilustrados por Jun Tsukasa. Algunos son jugables y otros solo sirven como apoyo. Cada personaje tiene una selección única de aviones para pilotar y una rama diferente de misiones para completar. Completar algunas misiones desbloquea misiones secretas y aviones ocultos para volver a jugar.

Al completar el juego, se activa un hangar secreto. A medida que se completa el juego y se ganan medallas, se activan más aviones secretos.

He aquí los personajes como naves de Konami que se deben Desbloquear :

• Vic Viper (Gradius)
• MX5000 (Flak Attack)
• Jerry Mouse (A-JAX)
• Falsion (Falsion)
• Blue Thunder M-45 (Thundercross)
• Twinbee (Twinbee)
• Quarth (Quarth)
• Sunfish (Space Manbow)
• S-Fighter (Trigon)
• Axelay (Axelay)
• Flintlock (Xexex)
• AuraWing (Crisis Force)
• Penta (Yume Penguin Monogatari)
• Poly (Tobe! Polystars)

El juego recibió críticas "promedio" según el sitio web de agregación de reseñas Metacritic.^[1]​ En Japón, Famitsu le otorgó una puntuación de un siete, dos ochos y un seis, para un total de 29 sobre 40.^[2]​ Henry Ernst, de GamePro Alemania, criticó que el juego no es divertido y que "el avión multimillonario se maneja como un ganso salvaje al que le han lanzado una carga de perdigones en el estómago, con extrema reticencia".^[3]​Atomic Dawg, de la versión estadounidense de GamePro , sin embargo, comentó: "Los gráficos son nítidos y limpios en general, y el juego presenta muchas tomas impecables de aviones y hermosos horizontes".^[4]​