AZTI fue fundado en 1981 con la creación del Servicio de Investigación Oceanográfica (SIO) en San Sebastián, bajo la transferencia de las competencias en materia de investigación científica y técnica por parte de la Comunidad Autónoma del País Vasco.^[2]​ En 1984, la Diputación Foral de Bizkaia autoriza la constitución de la Arrantzuarekiko Zientzia eta Teknika Ikaskundea (A.Z.T.I), un instituto dedicado a la ciencia y tecnología pesquera, con sede en Sukarrieta (Bizkaia). A partir de 1988, tras un periodo de coexistencia con el Servicio de Investigación Oceanográfica del Gobierno Vasco, ambas instituciones se fusionan para dar origen a AZTI-SIO, una empresa pública que asumió la gestión exclusiva de la investigación en el ámbito marino y pesquero, y amplió su ámbito de actuación al sector agroalimentario.^[3]​

En 1996, AZTI tomó la decisión de constituir un Centro Tecnológico Privado bajo la figura de la Fundación AZTI, buscando adaptarse mejor a las demandas del mercado y a la creciente necesidad de flexibilidad en su gestión. Este cambio permitió a AZTI combinar la gestión privada con su compromiso social y público. La Fundación AZTI fue creada en diciembre de 1997 con la colaboración de diversas empresas del sector agroalimentario y pesquero.^[3]​

En 2003, AZTI se integró en Tecnalia,^[4]​ la Corporación Tecnológica de Euskadi, lo que permitió a la organización ampliar su impacto y capacidades dentro del ecosistema científico-tecnológico del País Vasco. Sin embargo, en 2019 AZTI abandonó Tecnalia para integrarse en la Basque Research & Technology Alliance (BRTA),^[5]​ un consorcio creado con el fin de impulsar el ecosistema tecnológico de Euskadi. A partir de este momento, AZTI forma parte de BRTA junto con otros centros tecnológicos^[6]​ y el Gobierno Vasco, contribuyendo activamente a la investigación y la innovación en el ámbito marino y alimentario.^[7]​

AZTI se dedica a la investigación científica y tecnológica en dos áreas clave: el medio marino y la alimentación^[1]​.

La actividad de la organización está orientada a la sostenibilidad de los ecosistemas marinos,^[8]​ la gestión de recursos pesqueros^[9]​ y la conservación del medio ambiente marino,^[10]​ con un especial énfasis en aportar datos sobre la transformación de los océanos y sus recursos a causa de la crisis climática.^[11]​

Además AZTI se centra en la investigación y desarrollo en seguridad alimentaria,^[12]​ la creación de nuevos productos alimenticios^[13]​ y la nutrición de precisión,^[14]​ con la eficiencia y sostenibilidad de la cadena de valor alimentaria como eje transversal.^[15]​

AZTI trabaja en estrecha colaboración con empresas, instituciones y organismos internacionales. La organización también se dedica al fomento de la innovación colaborativa, la creación de valor y la transferencia de conocimiento a la industria y a la sociedad.^[16]​

La misión de AZTI^[1]​ es generar conocimiento y desarrollar proyectos de transformación social y económica mediante la innovación, contribuyendo a los desafíos globales de sostenibilidad. Para 2030, AZTI aspira a consolidarse como un referente europeo en el ámbito marino y alimentario, ofreciendo soluciones innovadoras para los sectores relacionados, alineadas con los ODS de las Naciones Unidas.^[1]​

AZTI se especializa en dos áreas principales de investigación:^[1]​

• El número de publicaciones científicas está por encima de las 140 publicaciones indexadas al año (>75 % en Q1), con más de 6300 citas a trabajos de AZTI este año. En cuanto a calidad, el número de citas supera las 30 citas por publicación. ^[17]​
• AZTI se encuentra en reconocida en el índice SCIMAGO que mide la excelencia a nivel global por la contribución a la Investigación, Innovación y el impacto social en el percentil que indica que solo un 33 % de las instituciones a nivel mundial de las áreas de conocimiento de AZTI tiene resultados iguales o mejores a los de este centro tecnológico.^[18]​

AZTI se especializa en dos áreas principales de investigación:^[1]​

• Medio Marino: Investigación en biodiversidad, gestión pesquera, conservación de los ecosistemas marinos y sostenibilidad del medio ambiente marino.
• Alimentación: Innovación en la cadena de valor alimentaria, con énfasis en seguridad alimentaria, desarrollo de nuevos productos, y promoción de hábitos alimenticios saludables.

AZTI tiene varias sedes en el País Vasco,^[19]​ lo que le permite desarrollar su actividad en estrecha relación con los sectores pesquero y agroalimentario:

Sukarrieta (Bizkaia): Txatxarramendi ugartea z/g, 48395 Sukarrieta - Bizkaia.

Pasaia (Gipuzkoa): Herrera Kaia, Portualdea z/g, 20110 Pasaia - Gipuzkoa.

Derio (Bizkaia): Parque Tecnológico de Bizkaia, Astondo Bidea, Edificio 609, 48160 Derio - Bizkaia.

AZTI es miembro activo de la Basque Research & Technology Alliance (BRTA) y socio de EIT Food, lo que le permite fortalecer su colaboración con otras entidades de investigación y desarrollar proyectos a nivel europeo en los ámbitos marino y alimentario.^[20]​

• Página web oficial de AZTI